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从病毒手里抢时间:百度研究院PaddlePaddle研发RNA测序算法检测速度提升120倍

从病毒手里抢时间:百度研究院PaddlePaddle研发RNA测序算法检测速度提升120倍

的有关信息介绍如下:

百度研究院PaddlePaddle研发的RNA测序算法LinearFold可将新型冠状病毒的全基因组二级结构预测速度提升120倍

百度研究院近日宣布,其研发的LinearFold算法在新型冠状病毒RNA空间结构预测方面取得了重大突破。该算法可将新型冠状病毒的全基因组二级结构预测时间从55分钟缩短至27秒,提速高达120倍,为疫情防控工作提供了有力支持。

算法背景与优势

LinearFold算法是百度于2019年7月首次提出的,该算法使得整序列、整基因组的RNA结构预测成为可能,是RNA结构预测领域40年来第一次重大提速。

相较于传统算法,LinearFold算法在时间复杂度上具有显著优势。传统RNA二级结构预测算法的时间复杂度为三次方,即序列长度翻一倍,计算时间需付出8倍的代价。而LinearFold算法则大大降低了这一时间成本,使得超长序列的RNA结构预测成为可能。

算法应用与效果

针对新型冠状病毒的基因组(长达3万个碱基),采用LinearFold算法,仅需27秒即可预测其结构。这一速度的提升,对于科学家深入了解新型冠状病毒基因组的性质、设计针对性药物以及加速疫苗研发等方面具有重要意义。

LinearFold算法的应用,不仅提升了基因检测、疫苗研发等科研中心的工作效率,还为疫情防控工作赢得了宝贵的时间。在疫情防控的关键时期,时间就是生命,速度就是力量。

算法开放与共享

百度研究院宣布,将向各基因检测机构、防疫中心及全世界科学研究中心免费开放LinearFold算法以及世界上现有最快的RNA结构预测网站。这一举措旨在助力全球科学家共同抗击疫情,加速新型冠状病毒RNA空间结构预测的研究进程。

LinearFold网站的开放,不仅为科学家提供了便捷的RNA结构预测工具,还促进了全球科研合作与交流。在疫情防控的全球化背景下,这一举措无疑具有重要意义。

百度在疫情防控中的其他贡献

除了LinearFold算法的研发与开放外,百度还在疫情防控方面做出了其他多项贡献。例如,百度上线了百度APP“抗击肺炎”频道、“在线问医生”服务免费通道、疫情相关关键词新闻聚合页面、开通辟谣专区、疫情实时大数据报告以及百度地图“发热门诊地图”等举措,全方位助力抗击疫情。

此外,百度还宣布成立总规模3亿元的疫情及公共卫生安全攻坚专项基金,用于支持新型冠状病毒等新疾病的治愈药物筛选、研发等一系列抗击疫情工作。这一举措体现了百度作为科技企业的社会责任感与担当。

从病毒手里抢时间:百度研究院PaddlePaddle研发RNA测序算法检测速度提升120倍

综上所述,百度研究院PaddlePaddle研发的RNA测序算法LinearFold在新型冠状病毒RNA空间结构预测方面取得了显著成果,为疫情防控工作提供了有力支持。同时,百度还通过多项举措积极参与疫情防控工作,展现了科技企业的社会责任感与担当。